据闻，有研究机构称我国地表水被检测出含有六十多种抗生素，其污染主要来源之一是水产养殖业。相关部门已严格限制水产养殖业使用抗生素，同时也加大力度对水产养殖领域抗生素替代品的研究。芽孢杆菌类尤其是枯草芽孢杆菌，作为一种可以替代抗生素的微生态制剂，具有很好的抗菌性和稳定性，广泛应用于水产养殖业。
（枯草芽孢杆菌）芽孢杆菌是一种需氧的非致病菌，以内孢子的形式存在于肠道微生物群落中，不消耗料养分，可保持饲料的质量，进人肠道后在肠道上迅速复活，复活率接近%。它能使空肠内的pH下降，氨浓度降低并消耗大量的氧，维持肠道厌氧环境，抑制病原菌的生长，维持肠道正常生态平衡，并有平衡乳酸菌的作用；它能分泌较强活性的蛋白酶及淀粉酶，促进淀粉、纤维素等分解。
芽孢杆菌的抗逆性很强，具有耐高温、耐酸碱、耐挤压等特点，可耐受颗粒饲料加工的影响。有试验证明在对虾饲料中添加5株芽孢杆菌经过整个生产工艺流程制粒后饲料中芽孢杆菌存活95%，烘干后恫料中芽孢杆菌存活93%。另有关资料报道，地衣芽孢可耐受℃高温，4-5分钟仍保持活性。目前，主要应用的主要有枯草芽孢菌、凝结芽孢杆菌、缓慢芽孢杆菌、地衣芽孢杆菌、短小芽孢杆菌、蜡样芽孢杆菌、环状芽孢杆菌、巨大芽孢杆菌、坚强芽孢杆菌、东洋芽孢杆菌、纳豆芽孢杆菌、芽孢乳杆菌和丁酸梭菌等。较为常用的是枯草芽孢杆菌，在使用时，枯草芽孢杆菌多制成该菌休眠状态的活菌制剂，或与乳酸菌混合使用。
（枯草芽孢杆菌菌落）水产养殖生产过程中，枯草芽孢杆菌主要作用是调节肠道菌群，维持微生态平衡。能抑制动物消化道中的大肠杆菌、沙门氏菌和促进乳酸杆菌生长的作用。枯草芽孢杆菌代谢产成的多肽类物质（枯草菌素）对某些有害菌（如嗜水气单胞菌、荧光单胞菌、迟缓爱德华氏菌、溶血链球菌、金黄色葡萄球菌等）有显著的抑制或杀灭作用。能分泌大量细胞外酶如蛋白醇、淀粉醇、纤维素酶、β-葡聚糖酶、脂肪酶及卵磷脂酶等，同时也分泌活性抗菌物质及挥发性代谢产物，提高水产动物的生产性能，提高饲料转化率和氨的利用率，减少氨和吲噪类化合物的生成。可提高动物对钙、磷、铁的利用，促进维生素D的吸收。同时具有净化养殖池塘的水质。二十多年来，很多水产动物领域专家学者针对枯草芽孢杆菌水产养殖应用做了大量研究和实验，特别是应用在饲料促生长、抗病方面，笔者摘取一部分文献记录，如下：
华雪铭等（）在异育银鲫饲料中添加0.2%芽孢杆菌，使得增重率提高了33%。
刘小刚等（）在异育银鲫饵料中添加0.1%和0.2%芽孢杆菌，肠道及肝胰腺蛋白酶、淀粉酶活性均显著提高。
Vaseeharan等（）发现枯草芽孢杆菌对哈维氏弧菌有明显的抑制作用，使黑虎虾的累积病死率降低90％。
朱学芝等（）在凡纳滨对虾饲料中添加0.1％枯草芽孢杆菌，发现其能显著提高凡纳滨对虾血细胞总量及血清酚氧化酶、碱性磷酸酶和酸性磷酸酶含量，且在攻毒14天内，明显降低死亡率。
Kumar（）研究表明，枯草芽孢杆菌能显著提高鲤鱼的巨噬细胞呼吸爆发能力和抗嗜水气单胞菌的能力，促进非特异性免疫力的提高。
齐欣等（）在彭泽鲫饲料中添加枯草芽孢杆菌显著提高其增重率和存活率，降低了饵料系数，并且在降低水体氨氮、亚硝酸盐及COD含量方面均有显著效果。
（粉状枯草芽孢杆菌制剂）枯草芽孢杆菌为杆状，很少成链。通常为（0.7-0.8）微米×（2.0-3.0）微米。染色均匀，鞭毛侧生，能运动，革兰氏阳性，芽孢呈椭圆形或柱状，中生或偏生，游离孢子表面着色弱。琼脂培养基上的菌落圆或不规则形，表面色暗，变厚和不透明，可起皱，可呈奶油色或褐色，菌落的形状随培养基成分不同而有很大变化。当琼脂培养基表面潮湿时，菌落易于扩散。在琼脂培养基上生长的菌苔在液体中不易扩散。在培养液中生成色暗、皱褶、完整的膜，培养液轻度混浊或不混浊。生长温度范围5-55℃，最适温度35-37℃。
（氨氮超高、蓝藻暴发的水体）枯草芽孢杆菌通过饲料添加作用于水产动物，要求效价（活菌量）为1亿CFU/克（或毫升），添加剂量为10公斤/吨。直接拌料投喂或作为微生物添加剂投入饲料生产制粒后投喂。拌料投喂时与乳酸菌合用，效果更佳。
枯草芽孢杆菌作为养殖水体水质改良剂使用。水温20℃以上，选择上午晴朗天气，水体溶氧充足时，直接进行全池泼洒，泼洒后开动增氧剂及耕水机，持续6-10小时，夜晚不停机。要求效价（活菌量）为10亿CFU/克（或毫升），泼洒量：育苗池，首次用g/亩*米水体，3天后用0g/亩*米水体，以后每隔15天用g/亩*米水体泼洒一次；标粗池，首次用1g/亩*米水体，以后每隔15天用g/亩*米水体泼酒一次；育成池，首次用0g/亩*米水体，以后每隔10天用g/亩*米水体泼酒一次。
枯草芽孢杆菌也可作为底质改良剂，选择颗粒包膜或缓释型枯草芽孢杆菌，使用前先投放增氧剂（过碳酸钠）进行底部增氧，2-3小时后干撒枯草芽孢杆菌颗粒，开动增氧机及耕水机，持续12-15小时，夜晚不停机。
（使用枯草芽孢杆菌改良后的水体）枯草芽孢杆菌可明显净化水质，降解池塘中的氨氮、亚硝酸盐、硫化氢及有机物，最大降解峰值出现在使用后的3-4天，有效时间可持续10天左右。但有一点必须注意！枯草芽孢杆菌耗氧，在使用枯草芽孢杆菌期间，应多多
